在跨学科研究中，选择一款合适的论文查重软件至关重要。首先，要考虑软件的查重准确度和覆盖范围，因为跨学科研究涉及多个领域，需要软件能够涵盖各个学科的文献数据库。其次，要考虑软件的使用便捷性和支持格式，跨学科研究中可能涉及到不同格式的文献，软件要支持多种格式的文献查重并且操作简便。另外，还要考虑软件的数据安全性和隐私保护，确保论文内容不会被泄露。综合考虑以上因素，可以选择一款综合性能良好、覆盖范围广、安全性高的论文查重软件。

除了上述因素外，还应该考虑软件的价格和服务支持。跨学科研究可能需要长期使用论文查重软件，因此要考虑软件的价格是否合适，并且要了解软件的售后服务和技术支持情况。可以选择一款性价比高、服务质量好的论文查重软件，以满足跨学科研究的需求。此外，还可以参考其他研究者的使用经验和评价，选择一款口碑良好的论文查重软件，提高查重效率和准确度。